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通過調節質子束的深度和形狀，對腫瘤進行高能量的“定向照射”, 與X射線相比，質子束有它的優越性，這些特性很大程度上減少了放射治療所帶來的副作用。

X射線進入人體時在皮膚附近釋放的能量最高，進入人體后則會逐步降低能量，所以到達腫瘤時就不一定是能量最高殺傷力最強的時刻，達不到充分的治療效果；而且射線會在穿透腫瘤后繼續釋放能量，損害周圍的正常組織。

質子束可以經過對腫瘤所在位置深度的調節，在皮膚附近以及到達腫瘤之前抑制能量的釋放，一旦到達腫瘤時便會瞬間釋放大劑量的能量，經過腫瘤后又馬上停止釋放能量，形成名為“布拉格峰”的能量釋放軌跡。

就是對這個“布拉格峰”的深度及形狀按照實際腫瘤的大小和位置進行調節，才真正實現了立體定向性的高效治療。

質子束在狙擊腫瘤時釋放最大能量，之后馬上停止釋放，這個能量釋放軌跡被稱為“布拉格峰”。并且，可以按照腫瘤的大小和體內所處深度調節質子束，調節后的能量釋放軌跡又稱為“擴大布拉格峰”

減少對正常組織的副作用和損害，由于布拉格峰的特性，質子治療可以有效地控制對腫瘤周圍正常組織的不良影響，比X射線帶來的副作用要少許多。

保證治療中和治療后的生活質量，減少對于正常組織的損傷，也就等于保證了患者在治療中和治療后的生活質量。

比如，在眼球內側形成的腫瘤，傳統的放射治療一定會損害視神經，大多患者別無選擇，只能擔著失明的風險接受治療。而質子治療可以控制甚至可以防止損害視神經，治療后的生活質量（QOL= QOL= Quality Of Life）也得到了保障。